燕军进宫之后，便忙于救火，当大火扑灭之后,燕军士兵从乾清宫的灰烬之中发现了一具已经烧焦的面目全非的尸体，分不清是男是女，但从尸体上残留的未烧焦的首饰来看，却是皇帝的信物无疑。朱棣心生疑惑，便找来太后吕氏当众认尸，太后不忍去看那烧焦的尸体，空气中弥漫着腐尸的气味，吕氏眼中止不住的泪水雨点般大滴大滴的滑落。
吕氏忍着刀割般的心痛，强撑着来到焦尸前，仔细看过之后，便确认那是建文帝无疑。
“皇嫂可是看仔细了？”朱棣半信半疑的问道。
“自己的骨肉，化成灰我也认得！”吕氏再抑制不住自己心中悲痛之情，咬着牙哭诉道。
朱棣见吕氏如此坚决，便顺水推舟突然当众哀叹痛哭道：“我这侄儿，怎如此这般痴傻，四叔起兵，是为了你清除朝中奸佞的，你怎会如此不理解四叔心意，就这么寻了短见呢！”
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徐妙锦与徐增寿自皇宫归来，便回到了中山王府，此刻徐辉祖已将自己关在祠堂中，祠堂大门紧锁，谢绝见客。
由于皇宫正殿已被焚毁，朱棣并没有立即搬进皇宫，而是仍暂居龙江燕军大营之中。也正是燕军入城这一日，建文年号正式被废，沿袭洪武年号，此为洪武三十五年。
随即又发一道令旨，直指奸臣误国，直接
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